Montaż Gruntowego Wymiennika Ciepła (GWC), podobnie jak montaż rekuperacji, realizowany jest w dwóch etapach. Etap pierwszy odbywa się poza budynkiem i dotyczy prac gruntowych. W zależności od rodzaju wymiennika trwa od o 1 do 2 dni. W trakcie tego etapu układamy w gruncie na określonej głębokości kolektor poziomy GWC. Na koniec całość jest zabezpieczana a w przypadku wymienników glikolowch wykonywana jest ciśnieniowa próba szczelności. W drugim etapie, wcześniej wykonany kolektor gruntowy łączony jest z instalacją wentylacyjną i rekuperatorem. Ze względu na rodzaj wymiennika i tutaj zakres prac przebiega nieco inaczej. W przypadku wymiennika glikolowego montowany jest moduł GWC do rekuperatora i cały ten zestaw łączony jest z kolektorem gruntowym. Wtedy też cała instalacja jest wypełniana roztworem glikolowym. Ważną częścią tych prac jest odpowietrzenie całej instalacji oraz wytworzenie odpowiedniego ciśnienia roboczego instalacji. W przypadku wymiennika powietrznego, kolektor gruntowy łączony jest bezpośrednio z rekuperatorem poprzez przepustnicę automatyczną, która decyduje o kierunku strumienia powietrza. Montowane są także czujniki temperatury GWC.
Bez względu na rodzaj GWC, ostatnią i bardzo ważną czynnością jest ponowna regulacja instalacji wentylacyjnej. Instalacja GWC to dodatkowy opór, który powstaje przed rekuperatorem a który należy pokonać poprzez odpowiednie ustawienie nawiewnego wentylatora w rekuperatorze.